Hiện nayastaxanthin(còn được gọi là siêu vitamin E) được sản xuất bởi các nguồn tổng hợp hoặc sinh học.
Có ba nguồn astaxanthin tự nhiên chính: chất thải của ngành chế biến thủy sản (động vật giáp xác như tôm và cua), Phaffia Rhodozyma và vi tảo (erythrococcus rauscens). Khai thác chất thải thủy sản, nghĩa là từ chất thải công nghiệp chế biến thủy sản, tất cả các loại khai thác chất thải chế biến thủy sản. Thuộc địa của Phaffia Rhodozyma có màu đỏ do sản xuất astaxanthin và các carotenoids khác, được phân bố đều trong lipid của các tế bào. Hàm lượng trung bình của astaxanthin trong men tự nhiên là 0,40%. Do đó, năng suất cao của astaxanthin trong men đã thu hút nhiều sự chú ý. Chiết xuất tảo, astaxanthin tự nhiên chủ yếu đến từ mưa haematococcus. Hàm lượng astaxanthin trong erythrochlorella rauscens là 1,5% ~ 3,0%, được coi là "cô đặc" của astaxanthin tự nhiên. Một số lượng lớn các nghiên cứu đã chỉ ra rằng mưa đỏ sống tìm thấy tỷ lệ tích lũy nguyên tố xanh tôm và khối lượng sản xuất cao hơn các loại tảo khác, và mưa đỏ sống tìm thấy tỷ lệ astaxanthin và este của nó (khoảng 70% este đơn, 25% este kép) và 5% tỷ lệ monome và động vật thủy sinh rất giống nhau, điều này được thực hiện bằng cách tổng hợp hóa học và sử dụng tóc đỏ, chiết xuất men astaxanthin không có lợi thế. Ngoài ra, cấu trúc của astaxanthin trong haematococcus eurainiae chủ yếu là loại 3S-3s, về cơ bản phù hợp với cấu trúc của astaxanthin trong các sinh vật dưới nước như cá hồi. Cấu trúc của astaxanthin là 3R - 3R. Hiện nay, erythrochlorella hydatiococcus được công nhận là sinh vật tốt nhất để sản xuất astaxanthin tự nhiên trong tự nhiên. Do đó, bằng cách sử dụng vi tảo này để chiết xuất astaxanthin chắc chắn có triển vọng phát triển rộng rãi, và đã trở thành trọng tâm của nghiên cứu quốc tế về sản xuất astaxanthin tự nhiên.
Astaxanthin tổng hợp không chỉ đắt tiền, mà còn khác biệt đáng kể so với astaxanthin tự nhiên về cấu trúc, chức năng sinh lý, hiệu quả ứng dụng và an toàn. Astaxanthin tổng hợp có thể có nguồn gốc hóa học từ carotene. Đây là nguồn astaxanthin quan trọng nhất trong thức ăn cho cá, và năng lực sản xuất tổng hợp toàn cầu là BASF, DSM, các công ty mới và shing. Về cấu trúc, astaxanthin tự nhiên chủ yếu là 3S, 3 (thuận tay trái), trong khi astaxanthin tổng hợp là hỗn hợp của ba cấu hình, và 3R, 3 (racemic) là cấu hình chính. Ngoài ra, astaxanthin tổng hợp không thể được chuyển đổi thành cấu hình tự nhiên của nó ở động vật. Về chức năng sinh lý, sự ổn định và hoạt động chống oxy hóa của astaxanthin tự nhiên cao hơn đáng kể so với astaxanthin nhân tạo. Trong hiệu ứng ứng dụng, sự hấp thụ sinh học và màu sắc của astaxanthin tự nhiên tốt hơn so với astaxanthin nhân tạo.